エクリプス系（エクリプスけい、Eclipse Sire Line）とは、馬（サラブレッドの他クォーターホース等）の父系の一つ。ダーレーアラビアン（Darley Arabian）を始祖とする。本来ならばダーレーアラビアン系とすべきであるが、現在のダーレーアラビアンの父系に属するサラブレッドは全てエクリプス（Eclipse）の直系子孫であるためエクリプス系と呼ばれている。アラブ種やスタンダードブレッドを除く、サラブレッド、クォーターホース、セルフランセ等の主要馬種のほとんどで主流血統を形成しており、特にサラブレッドの97%はエクリプス系に属するとされる（2014年に日本で生産されたサラブレッドにおけるシェアは99.85%である。残りは全てマッチェム系）。 Y染色体ハプロタイプは、ないしである。ハプロタイプ2はアラブ種に多く、ダーレーアラビアンやエクリプス自身はハプロタイプ2であったと考えられている。セントサイモン系やフライングチルダーズ系、ヤングマースク系はハプログループ2（ハプロタイプ2からなる集団）に属している。
