フラッグ・キャリア（英語: flag carrier）は、ある特定の国を代表し、対外的にも一番知名度が高い航空会社や船舶会社を指す。 かつては、政府所有の船会社や航空会社を指すために使用されていたが、国有エアラインが民営化されたケースもあり、現在では政府所有の如何は問わないことが多い。このような航空会社は、国によっては法的に異なる意味を持つ場合もあるが、ナショナル・エアライン（英語: national airline）またはナショナル・キャリア（英語: national carrier）として知られている。 航空機や船舶にその国の国旗を表示することを義務付ける法律があるため、フラッグキャリアと呼ばれることもある。例えば、米国の法律では、米国旗航空会社（U.S. flag air carrier）とは、1958年連邦航空法 第401条に基づく証明書を保有する航空会社（すなわち、米国を拠点に国際的に運航する航空会社）のことであり、米国で登録された船舶は米国旗船（U.S. flag vessel）として知られている。
