数学において,ルート系(英: root system,仏: système de racines)とはある幾何学的な性質を満たすユークリッド空間のベクトルの配置である.これはリー群やリー環の理論において基本的な概念である.リー群(や代数群のような類似物)やリー環は20世紀の間に数学の多くの部分で重要になってきたから,ルート系の一見すると特別な性質に反してそれらは多くの分野に応用される.さらに,ディンキン図形によるルート系の分類体系は(のような)リー理論とあからさまなつながりの全くない数学の分野において現れる.最後に,ルート系はスペクトルグラフ理論におけるように,それ自身重要である.