病原性因子（びょうげんせいいんし、英: Virulence factors、病原因子）とは、微生物（細菌、真菌、ウイルス、および原生動物）によって産生される化学物質であり、その微生物の病原性の発現に最低限必要なものである。例えば以下の効果を持つ物質である。 * 宿主体内または体表にあるニッチ空間における微生物のコロニー形成を促すもの * 宿主の免疫応答から微生物を回避（免疫回避）させるもの * 宿主の免疫応答を阻害（免疫抑制）するもの * （細胞内侵入性細菌の場合）宿主細胞への出入りを促すもの * 宿主からの栄養素の獲得を担うもの * 宿主のコロニー形成を補助または促進する。この形式の因子にはアドヘシンや、抗貪食因子などがある。 * 宿主を攻撃する。この形式の因子には毒素や溶血素、タンパク質分解酵素などがある。
