シスキュー郡(シスキューぐん、英: Siskiyou County、発音:SISS-kyoo)は、アメリカ合衆国カリフォルニア州最北部に位置する郡であり、オレゴン州との州境のシャスタ・カスケード地域に位置する。2010年国勢調査での人口は44,900人だった。郡庁所在地はワイリーカである。自然の景観に溢れアウトドア活動ができ、カリフォルニア・ゴールドラッシュ時代の歴史もあるので、州内でも重要な観光地になっている。