ジャヤプラ(インドネシア語:Kota Jayapura)は、インドネシア共和国パプア州の州都。ニューギニア島中北部に有り、ヨス・スダルソ湾に面する。面積は935.92km2で、人口は2014年時点で約31.6万人である。西にジャヤプラ県、南にケーロム県、東にパプアニューギニア、北に太平洋に面する。ジャヤプラはインドネシア領ニューギニアで最大の都市である。センタニ湖の近くにセンタニ空港が有る。高速道路が国境近くのスコウを経由して、国境の向こうのヴァニモに繋がっている。ジャヤプラと西のサルミを鉄道で繋ぐ計画が有る。更に伸ばしてマノクワリやソロン(共に西パプア州)まで繋ぐ計画も有る。この計画は2030年までに完了する予定である。