鳥羽市水産研究所（とばしすいさんけんきゅうじょ）は、三重県鳥羽市が設置する水産研究所。市立の水産研究所は日本国内では珍しい存在である。所員2人の小規模な研究所であるが、創設以来漁業者の目線に立ち、藻類を中心とした種苗生産と研究を続けてきた。2020年（令和2年）まで研究所は坂手島にあったが、鳥羽市は持続可能な漁業を推進し地域経済の発展に寄与させるため、同年4月に本土の小浜町へ新築移転した。
