内薗 耕二（うちぞの こうじ、1916年10月9日 - 2006年10月25日）は、日本の医学者（生理学）。階級は海軍中尉。勲等は勲二等。学位は、医学博士（東京大学・1950年）。東京大学名誉教授、静岡県立大学名誉教授、生理学研究所名誉教授。 東京帝国大学医学部副手、東京大学医学部講師、新潟大学医学部教授、東京大学医学部教授、生理学研究所所長（初代）、岡崎国立共同研究機構機構長（第2代）、静岡女子大学学長（第5代）、静岡県立大学学長（初代）、静岡県立大学短期大学部学長（初代）などを歴任した。
