代謝異常（たいしゃいじょう、英: metabolic disorder）とは、タンパク質、脂肪、炭水化物などの主要栄養素の体内での加工と分配を有害に変化させる疾患である。代謝障害とも呼ばれる。代謝異常は、体内の異常な化学反応が、正常な代謝過程を変化させることで起こることがある。また、これは遺伝性の単一遺伝子疾患と定義することもでき、その多くは常染色体劣性である。
