ハインリヒ・フォン・シーボルト（ドイツ語: Heinrich von Siebold, 1852年7月21日 - 1908年8月11日）は、オーストリアの外交官・考古学者。 父はフィリップ・フランツ・フォン・シーボルトで、研究分野において父との区別のため「小シーボルト」とも呼ばれる。兄は外交官で、井上馨外務卿の秘書となったアレクサンダー・フォン・シーボルト、異母姉に日本人女性として初の産婦人科医となる楠本イネがいる。ドイツ出身であるが、後に外交官としての功績が認められ、オーストリア＝ハンガリー帝国の国籍を得る。 ハインリッヒを主人公とした舞台『シーボルト父子伝〜蒼い目のサムライ』（演出木村ひさし、主演/脚本鳳恵弥、音楽パッパラー河合爆風スランプ）が2020年より毎年公演されている。
