長崎代官(ながさきだいかん)は、長崎を治めた代官。長崎代官と称される役職には、 1. * 後に長崎奉行と称せられる役職 2. * 長崎地下の頭人的な役割を持ち、後に外町支配となる役職 3. * 近世中期に長崎周辺の幕府領を統治するために設けられた役職 があった。ここでは主に、2番目と3番目の長崎代官について扱う。