藤本 健太郎（ふじもと けんたろう、1967年4月 - ）は、日本の厚生官僚、外交官、行政学者（社会保障論・公共政策論）。静岡県立大学経営情報学部副学部長・大学院経営情報イノベーション研究科教授。 在ドイツ大使館一等書記官、内閣官房行政改革推進事務局特殊法人等改革推進室参事官補佐、大分大学教育福祉科学部助教授、大分大学教育福祉科学部准教授、静岡県立大学経営情報学部准教授などを歴任した。
