工藤 祐舜（くどう ゆうしゅん、1887年（明治20年）3月26日 - 1932年（昭和7年）1月8日）は、日本の植物学者。現在の秋田県平鹿郡増田町（現横手市）縫殿生まれ。植物分類学の泰斗として知られる。 父祐哲は浄土真宗の寺院の19世住職であり、祐舜は長男であったが、のちに弟祐信を養子として寺を継がせている。
