ナタマイシン（natamycin, INN）は、通常土壌中に見いだされる微生物Streptomyces natalensisによる発酵の際に生産される天然の抗真菌薬である。1958年に構造決定された。ピマリシン (pimaricin) としても知られる。両親媒性を示すため、ナタマイシンの水への溶解度は非常に低い。しかしながら、ナタマイシンは非常に低い量で効果を示す。ほとんどのかびに対して10 ppmより低い最小発育阻止濃度 (MIC) を示す。ナタマイシンは、マクロリドポリエン系抗真菌薬に分類され、薬としては真菌性角膜炎 (keratitis) の治療に使用される。ナタマイシンは特に、アスペルギルス属 (Aspergillus) およびフザリウム属 (Fusarium) の角膜への感染に対して有効である。 その他のポリエン系抗真菌薬は、アムホテリシンB、ナイスタチン、フィリピンなどである。
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