グアニンヌクレオチド交換因子 (ぐあにんぬくれおちどこうかんいんし、guanine nucleotide exchange factor, GEF)とは、GTP結合タンパク質(GTPase)上に結合しているグアノシン二リン酸(GDP)の放出を促進してグアノシン三リン酸 (GTP)を結合させることによって、GTP結合タンパク質(GTPase, GTPアーゼ) の活性化を行うタンパク質またはタンパク質ドメインのことである。様々な関連のない構造ドメインがGEFとしての活性を有することが示されている。一部のGEFは複数種類のGTPアーゼを活性化することができるが、その他は1種類のGTPアーゼに対して特異的に機能する。