This HTML5 document contains 149 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

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Statements

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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:オルトコロナウイルス亜科
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:ゲノム不安定性
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
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dbpedia-ja:核酸の三次構造
Subject Item
dbpedia-ja:核酸の三次構造
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核酸の三次構造
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核酸の三次構造（かくさんのさんじこうぞう）とは、核酸ポリマーの三次元的形状を指す。RNAとDNAの分子は、分子認識や触媒などさまざまな機能を有する。このような機能を発揮するには正確な三次構造を取る必要がある。その構造は多様で一見複雑であるものの、簡単に認識できる三次構造モチーフがビルディングブロックとなって構成されている。ここではRNAとDNAの三次構造の最も一般的なモチーフの一部について記述するが、これらの情報は限られた数の既知構造に基づいている。新たなRNAやDNA分子の構造が解明されれば、さらに多くの三次構造モチーフが明らかとなるであろう。
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Oceanobacillus IheyensisのグループIIイントロンでみられるmajor groove triplex。スタッキングした各層が異なる色で示されている。三重鎖間の水素結合は黒い破線、窒素原子は青、酸素原子は赤で示されている。 II型A-マイナー相互作用: II型相互作用は、アデノシンの2'-OH基とN3の相互作用を伴う。アデノシンは副溝のシトシンの2'-OH基と相互作用する。この相互作用の強さはTypeI相互作用と同程度である。 I型A-マイナー相互作用: I型の相互作用は最も一般的で最も強固なA-マイナー相互作用である。多数の水素結合を伴い、副溝へ差し込まれたA塩基は埋め込まれる。 外圏型（outer sphere）の配位を示す、グループIイントロンのP5c結合ポケット。ここでは、通常は水が行っている機能をオスミウムヘキサミンの6つのアミンが果たしており、主溝とイオンの相互作用を媒介している。水素結合を介した配位が破線で示されており、オスミウムはピンクで示されている。他の色は上の図と同じである。 ヒトのテロメラーゼRNAのシュードノット内で形成されたmajor groove triplex 。水素結合は黒の破線、窒素原子は青、酸素原子は赤で示されている。 マラカイトグリーンのRNAアプタマーの結晶構造中にみられる四重鎖構造。G29は他の塩基と、主溝と副溝での水素結合、ワトソン・クリック型の水素結合を形成している。 グループIイントロンの内圏型（inner sphere）のマグネシウムの配位。2つの赤い球はマグネシウムイオン、イオンから伸びる破線はヌクレオチドの各官能基との配位を示している。緑=炭素、オレンジ=リン酸、赤=酸素、青＝窒素 。 典型的なフーグスティーン型塩基対を形成したGカルテットのリング構造。
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RNA三重鎖 A-マイナー相互作用 四重鎖 グループIイントロン中の金属イオンの結合
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isolated_triplex_2K95.png RNA Quadruplex.png 3 A_minorII.png Quadruplex1_s.png mginnersphere.png cate.bindingpocket2.png EditedA-minor-motif_type1.png
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核酸の三次構造（かくさんのさんじこうぞう）とは、核酸ポリマーの三次元的形状を指す。RNAとDNAの分子は、分子認識や触媒などさまざまな機能を有する。このような機能を発揮するには正確な三次構造を取る必要がある。その構造は多様で一見複雑であるものの、簡単に認識できる三次構造モチーフがビルディングブロックとなって構成されている。ここではRNAとDNAの三次構造の最も一般的なモチーフの一部について記述するが、これらの情報は限られた数の既知構造に基づいている。新たなRNAやDNA分子の構造が解明されれば、さらに多くの三次構造モチーフが明らかとなるであろう。
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