蛍光顕微鏡（けいこうけんびきょう、Fluorescence microscope, Epifluorescent microscope, MFM）は、生体または非生体試料からの蛍光・燐光現象を観察することによって、対象を観察する顕微鏡である。反射光や透過光画像と同時に観察することもある。生物学・医学における研究、臨床検査、浸透探傷検査などに用いられる。
