藤本 康太(ふじもと こうた、1986年4月2日 - )は、熊本県出身の元プロサッカー選手、サッカー指導者。ポジションはミッドフィールダー・ディフェンダー。現役時代はセレッソ大阪一筋でプレーした。 J1リーグ戦で、プロ初ゴールからの連続得点記録保持者(4試合)。実弟は同じくサッカー選手の藤本大。