組換えタンパク質（くみかえタンパクしつ、英: recombinant protein）とは、遺伝子工学的手法によりベクター上にクローン化されたDNA（組換えDNA、英: recombinant DNA）から転写、翻訳されたタンパク質である。 組換えタンパク質は主に目的タンパク質の機能解析や大量生産のために作られる。 なお、生物学では「組み換え」ではなく「組換え」と表記するのが通例となっている。
