第12期竜王戦(だい12きりゅうおうせん)は、1999年度(1998年11月9日 - 1999年12月26日)の竜王戦である。竜王戦七番勝負は、藤井猛竜王が鈴木大介六段に4勝1敗で制した。藤井はタイトルを防衛し、2期連続2期目の竜王位獲得を果たした。