生物色素または生体色素（英語:biological pigment, pigment, biochrome）は、生物によって産生される物質で、選択的な吸光によって色を呈するものを指す。植物色素や花色素がある。皮膚、目、羽毛、毛皮、毛などの多くの生体構造は色素胞と呼ばれる特殊な細胞にメラニンなどの色素を含んでいる。一部の種では、色素は個体の寿命の非常に長い期間にわたり蓄積される。 色素色はどの角度から見ても同じ色を呈するという点で構造色とは異なる。構造色は普通は多層構造による選択的な反射や玉虫色光沢によって色を呈するものである。例えば、チョウの羽は典型的には構造色によって色を呈するが、多くのチョウには色素を含む細胞も存在している。
