熊野本遺跡(くまのもといせき)は、滋賀県高島市新旭町熊野本にある遺跡。饗庭野台地(あいばのだいち)にある遺跡で、これまでの発掘調査で多数の竪穴住居・ 掘立柱建物・墳丘墓などが見つかっている。竪穴住居の分布が東西300m×南北200m、面積6ヘクタールの大規模なムラであったと思われる。今から約2000年前に最も発達し、墳丘墓が築かれる約1800年前に衰退したと考えられる。