慶應義塾大学総合医科学研究センター（けいおうぎじゅくだいがくそうごういかがくけんきゅうせんたー、英: Center for Integrated Medical Research, Keio University）は、慶應義塾大学医学部の附置研究所で、生命科学の高度な研究成果を広く社会に還元することを目的として設置されている。設立以来、幹細胞研究や代謝研究などを中核に教育研究拠点として高度化されており、産学連携プロジェクトや国家プロジェクトも積極的に推進している。 慶應義塾大学信濃町キャンパス（東京都新宿区）の総合医科学研究棟にある。
