専門外来（せんもんがいらい）とは、ある疾患または症状に対して、専門的な診察・治療を行う専門の外来科を指す。また、診療科よりも更に細分化されたものを指すこともある。 多くの病院・医院の場合、「内科の○○専門外来」と言うように診療科に附属して開設されており、担当医も専門医・指導医レベルの医師・歯科医師が就くことが一般的である。ただし専門外来では治療対象が多岐にわたることもあり、特に総合病院では他科の医師と提携して治療を行う場合もある。 なお、現在のところ専門外来の表記についての規制法規は存在しない。
