代謝中間体(たいしゃちゅうかんたい、Metabolic intermediate)とは、生化学的に重要な分子の前駆体もしくは代謝産物である分子のことである。代謝中間物とも呼ばれる 代謝中間体は細胞機能における重要度は比較的低いが、酵素のアロステリック制御において重要な役割を持つ。