下村 孝太郎（しもむら こうたろう、1861年10月29日（文久元年9月26日） - 1937年（昭和12年）10月21日）は、日本の化学技術者。工学博士。同志社第6代社長（現総長）。 父は熊本藩士の二男で下村家を相続した。軍人石光真清・真臣兄弟はいとこ。野田豁通は叔父。妻とくは、京都府知事北垣国道の養女。馬鈴薯王の牛島謹爾の妻（四女）、浮田和民の先妻の末、後妻の五女（いつめ）, 富山薬学専門学校校長, 愛知薬学校校長の小野瓢郎の妻は孝太郎の妹である。
