マルゲリータ・ゴンザーガ(Margherita Gonzaga, 1564年5月27日 - 1618年1月6日)は、イタリア・マントヴァ公国の支配者ゴンザーガ家の公女で、フェラーラ、モデナおよびレッジョ公アルフォンソ2世の3番目の妻。