パパイン様プロテアーゼ（パパインようプロテアーゼ、英: papain-like protease、PLpro）は、コロナウイルスの複製に不可欠なシステインプロテアーゼで、CAグループペプチダーゼ（C16ファミリー）に属する。パパイン様プロテアーゼ（PLpro）の主な機能は、ウイルスのを協調して処理することである。ただし、PLproには、コロナウイルスの回避を助けるために、宿主細胞のタンパク質からユビキチンとを除去するという付加的な機能がある。これらの理由から、PLproはSARS-CoVに対する抗ウイルス剤の研究における治療標的となっている。
