セパラーゼまたはセパレース(英: separase)は、コヒーシンを加水分解することで有糸分裂の後期の開始を担うシステインプロテアーゼである。コヒーシンは後期の初期段階で姉妹染色分体の結合を担っているタンパク質である。セパラーゼは、ヒトではESPL1遺伝子にコードされる。セパリン(英: separin)とも呼ばれる。