スバンテ・ペーボ（Svante Pääbo [ˈsvanˈtɛ ˈpɛːbʊ]、1955年4月20日 - ）は、エストニア系スウェーデン人の遺伝学者で、進化遺伝学の分野を専門としている。古遺伝学の創始者の一人であり、ネアンデルタール人のゲノムの研究に大きく貢献した 。1997年より、ドイツ・ライプチヒのマックス・プランク進化人類学研究所の遺伝学部門の創設責任者を務めている 。また、日本の沖縄科学技術大学院大学教授でもある。 2022年、「絶滅したヒト科動物のゲノムと人類の進化に関する発見」でノーベル生理学・医学賞を受賞 。
