Fボックスタンパク質(英: F-box protein)は、少なくとも1つのF-boxドメインを含むタンパク質の総称である。最初に同定されたF-boxタンパク質はSCF複合体の3つの構成要素のうちの1つであり、このタンパク質は26Sプロテアソームによる分解標的となるタンパク質のユビキチン化を媒介する。