2006年のスーパースポーツ世界選手権は、F.I.M.が主催するスーパースポーツ世界選手権の第8回目のシーズン。2月25日のロサイル・インターナショナル・サーキットで開幕、10月8日のマニクール・サーキットで閉幕し、全12戦でタイトルが争われた。 セバスチャン・シャルパンティエが6勝を挙げライダーズ・タイトルを制し、マニファクチャラーズ・タイトルはホンダが獲得した。
