1999年の全日本GT選手権(JGTC)は、1999年3月20・21日に鈴鹿サーキットで開幕し、1999年10月23・24日にツインリンクもてぎで閉幕した全7戦と、11月27・28日にオートポリスでのオールスター戦(ノンタイトルレース)とのシリーズである。