自衛隊京都地方協力本部(じえいたいきょうとちほうきょうりょくほんぶ、Kyoto Provincial Cooperation Office)は、京都府京都市中京区西ノ京笠殿町38京都地方合同庁舎3階に所在する、自衛隊地方協力本部のひとつ。陸・海・空自衛隊共同の機関だが、通常は陸上自衛隊の中部方面総監の指揮監督下にある。管轄する地域における防衛省・自衛隊の総合窓口として京都府管内で活動する。