慶應医学賞（けいおういがくしょう、The Keio Medical Science Prize）は、世界の医学・生命科学の領域において、医学を中心とした諸科学の発展に寄与する顕著、かつ創造的な研究業績を上げた研究者に対して、慶應義塾医学振興基金が与える学術賞である。 受賞者は毎年、日本国内と日本国外から各1名（またはどちらか1名のみ）が選出され、賞状とメダルおよび賞金各1000万円が贈られる。授賞式は慶應義塾大学で行われ、受賞者による記念講演会およびシンポジウムが開催される。本賞の受賞者51名のうち、7名が後にノーベル生理学・医学賞を、2名が後にノーベル化学賞を受賞している（2022年10月現在）。
