ニューヨーク州立大学ストーニーブルック校(ニューヨークしゅうりつだいがくストーニーブルックこう、英: The State University of New York at Stony Brook)、もしくはストーニーブルック大学(ストーニーブルックだいがく、英語: Stony Brook University)は、ニューヨーク州に本部を置くアメリカ合衆国の研究型州立大学である。1957年に設置された。 4つあるニューヨーク州立大学機構の大学センターの1つ。メインキャンパスの他、マンハッタン、サウサンプトンにキャンパスを置く。アメリカ合衆国エネルギー省の下ブルックヘブン国立研究所の共同運用を行う。