第79回天皇杯全日本サッカー選手権大会(だい79かいてんのうはいぜんにほんサッカーせんしゅけんたいかい)は、1999年11月28日から2000年1月1日まで開かれた天皇杯全日本サッカー選手権大会である。 この大会は名古屋グランパスエイトが4年ぶり2度目の優勝。