甲状腺自己抗体(抗甲状腺抗体、Anti-thyroid autoantibodies、またはanti-thyroid antibodies)とは甲状腺の成分を抗原とする自己免疫性甲状腺疾患で陽性となる自己抗体である。橋本病で陽性となる抗TPO抗体、抗Tg抗体とバセドウ病で陽性となる抗TSH受容体抗体が有名である。