根本 直人（ねもと なおと、1958年 - ）は、日本の生物学者・者。学位は、博士（学術）（埼玉大学・1996年）（学位論文「遺伝子型/表現型対応付けにおけるウイルス型戦略の研究」）。埼玉大学大学院理工学研究科物質科学部門教授。
