山形市農業協同組合(やまがたしのうぎょうきょうどうくみあい、略称JA山形市、山形市農協)は、山形県山形市に本店を置く農業協同組合。管轄は山形市内の中心部で旧市街地区を中心としている。旧市街以外の地区は同市旅篭町に本店を置く山形農業協同組合が管轄するが、定款上の営業エリアとしては山形市全域は重複する。