在ハバロフスク日本国総領事館（ロシア語: Генеральное Консульство Японии в Хабаровске、英語: Consulate-General of Japan in Khabarovsk）は、極東ロシアハバロフスク地方のハバロフスクに設置されている日本の総領事館。ハバロフスク地方、ユダヤ自治州、アムール州、サハ共和国（ヤクーチャ）、ザバイカル地方、ブリヤート共和国、イルクーツク州を管轄する。 2017年10月1日時点で管轄区域内の在留邦人数は68人となっており、これは在外公館別で第207位、総領事館の中では在ユジノサハリンスク日本国総領事館と並んで最小規模である。
