本項では主に分子力学法または分子動力学法の計算に用いられるプログラムの一覧を示す。 * GPU – GPUが利用可能 * I – インターフェースのみ * Imp – 水の陰溶媒 * MC – モンテカルロ法 * MD – 分子動力学 * Min – 構造最適化 * QM – 量子力学的手法 * REM – レプリカ交換法