RNAが持つ塩基は通常、アデニン、ウラシル、グアニン、シトシンの4種であるが、一部のRNA（tRNA、rRNA、snRNAなど）は転写後修飾を受け、通常とは異なる構造の塩基、ヌクレオチドを含むことが多い。修飾を受けたヌクレオチドを修飾塩基（しゅうしょくえんき、modified base）という。微量塩基（びりょうえんき、minor base、rare base）とも呼ばれる。
