株式会社丸善ジュンク堂書店(まるぜんじゅんくどうしょてん、英: MaruzenJunkudo Bookstores Co.,Ltd.)は、日本の大手書店。旧丸善(現在の丸善雄松堂)から分割された「丸善」ブランドの書店と旧株式会社ジュンク堂書店が運営していた「ジュンク堂書店」を運営している。大日本印刷の子会社である丸善CHIホールディングスの完全子会社である。 登記上の本店および本社は旧丸善の本店である、東京都中央区日本橋二丁目(丸善日本橋店)に置かれているが、本部は新宿区四谷三栄町に置かれている。