フクロホシムシ科(フクロホシムシか、Golfingiidae)は、星口動物門スジホシムシ綱の科。3属から構成されるが、各属は食道に沿って伸びる管(収縮管)の柔毛の有無と、体腔内にあって陥入吻に繋がる筋肉である牽引筋の本数によって区別される。 スジホシムシ綱は触手が口を囲むことが特徴で、本科はそのなかでも体壁の筋肉のうち縦筋が分離しないことから、フクロホシムシ目に分類される。フクロホシムシ目には本科のほかに2つの科があるが、エダホシムシ科とは触手の枝分かれがないこと、マキガイホシムシ科とはが2本あることで識別できる。 低水温の海域に多く分布し、砂などに埋もれて生活していることが多い。小型の種が多く、3センチメートルを超えるものはほとんどいない。