バウペス県(バウペスけん、スペイン語: Departamento del Vaupés)は、コロンビア南東部のアマゾン地方の県。県都はミトゥー。東はブラジルと国境を接し、南にアマソナス県、北にカケタ県、グアヴィアーレ県、グアイニア県と接する。