ニューヨーク市地下鉄の運行系統の一覧を以下に示す。 2016年現在、ニューヨーク市地下鉄では25のアルファベットまたは数字でラベルされた運行系統が使われている。 * 1、6、7、C、G、L、M、R、W：緩行線 * 2、3、4、5、<6>、<7>、A、B、D、E、F、N、Q：急行線 * J：通常は緩行線、ラッシュ時の混雑方面はZとともに急行線 * S：シャトル線（ロッカウェイ・パーク・シャトル、フランクリン・アベニュー・シャトル、および42丁目シャトル）
