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- タンパク質ドメイン進化的分類(タンパクしつドメインしんかてきぶんるい、英: Evolutionary Classification of Protein Domains、ECOD)は、蛋白質構造データバンク(PDB)から入手可能なタンパク質ドメインを分類したである。ECODは、タンパク質間の進化的関係を決定しようとするものである。 ECODは、Pfam、CATH、SCOPと同様に、タンパク質全体ではなくドメインを収集する。ただし、ECODは進化的関係に重点を置いている。ECODでは、単純に収斂進化を示す可能性のあるフォールドによってタンパク質を分類するのではなく、実証可能な相同性のみによってタンパク質を分類している。 (ja)
- タンパク質ドメイン進化的分類(タンパクしつドメインしんかてきぶんるい、英: Evolutionary Classification of Protein Domains、ECOD)は、蛋白質構造データバンク(PDB)から入手可能なタンパク質ドメインを分類したである。ECODは、タンパク質間の進化的関係を決定しようとするものである。 ECODは、Pfam、CATH、SCOPと同様に、タンパク質全体ではなくドメインを収集する。ただし、ECODは進化的関係に重点を置いている。ECODでは、単純に収斂進化を示す可能性のあるフォールドによってタンパク質を分類するのではなく、実証可能な相同性のみによってタンパク質を分類している。 (ja)
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- Grishin Lab, (ja)
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- 新規タンパク質は手動。照合したもののために自動化。 (ja)
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- http://prodata.swmed.edu/ecod/|format=|standard=|released=2014|pmid=25474468|author=H. Cheng, R. D. Schaeffer, Y. Liao, L. N. Kinch, J. Pei, S. Shi, B. H. Kim, N. V. Grishin. (ja)
- http://prodata.swmed.edu/ecod/|format=|standard=|released=2014|pmid=25474468|author=H. Cheng, R. D. Schaeffer, Y. Liao, L. N. Kinch, J. Pei, S. Shi, B. H. Kim, N. V. Grishin. (ja)
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- タンパク質ドメイン進化的分類(タンパクしつドメインしんかてきぶんるい、英: Evolutionary Classification of Protein Domains、ECOD)は、蛋白質構造データバンク(PDB)から入手可能なタンパク質ドメインを分類したである。ECODは、タンパク質間の進化的関係を決定しようとするものである。 ECODは、Pfam、CATH、SCOPと同様に、タンパク質全体ではなくドメインを収集する。ただし、ECODは進化的関係に重点を置いている。ECODでは、単純に収斂進化を示す可能性のあるフォールドによってタンパク質を分類するのではなく、実証可能な相同性のみによってタンパク質を分類している。 (ja)
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- タンパク質ドメイン進化的分類データベース (ja)
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