ジョナサン・D・ジョーンズ(Jonathan D. Jones、1989年8月2日 - )は、アメリカ合衆国・カリフォルニア州出身の元プロ野球選手(中堅手)。右投右打。 マイナーリーグ時代の登録名はジョン・ジョーンズ(Jon Jones)。