ジュニアータ郡（英: Juniata County）は、アメリカ合衆国ペンシルベニア州の中央部に位置する郡である。2010年国勢調査での人口は24,636人であり、2000年の22,821人から8.0%増加した。郡庁所在地は・ボロ（人口936人）であり、同郡で人口最大の町でもある。ジュニアータ郡は1831年3月2日にミフリン郡から分離して設立された。郡名はジュニアータ川から採られた。
